| Titre : |
Extraction, quantifification et caractérisation des protéines du sol : vers un nouvel indicateur biologique ? |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Amandine Clément, Auteur |
| Année de publication : |
2014 |
| Importance : |
57 p. |
| Format : |
Version papier + Cd |
| Note générale : |
Mémoire de projet ingénieur
Lieu de stage : Agri'terr Esitpa (76130 Mont Saint Aignan)
Non confidentiel
Président du jury : Isabelle Gattin . |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
Bio-indicateur protéomique extraction protéines du sol sols agricoles grande culture prairie permanente sols limoneux Bradford électrophorèse 2-D SDS-PAGE |
| Résumé : |
L’étude des protéines du sol est importante, dans l’objectif de mieux
comprendre les fonctionnements biologique du sol. La protéomique du
sol est en effet une clé dans la compréhension des relations entre
structure et fonctions des communautés microbiennes. Elle pourrait
constituer un nouveau bio-indicateur.
Dans cette étude, six protocoles d’extraction des protéines ont été
testés (WSP, SP, SDS, NaOH, RG et ADN) sur un sol de grande
culture (GC) et un sol de prairie permanente (PP). La quantité de
protéines extraites par chaque protocole a été évaluée grâce au dosage
de Bradford. La qualité des extraits protéiques a été comparée par
électrophorèse mono (SDS-PAGE) et bi dimensionnelle (2D).
Tous les protocoles ont conduit à l’obtention d’extraits riches en
protéines (de 0.11 à 1.08 mg.g-1 de sol sec pour GC et de 0.13 à 0.95
mg.g-1 de sol sec pour PP). Le protocole « RG » donne les meilleurs
résultats quantitatifs autant en GC qu’en PP. Cependant c’est aussi
celui qui possède la solution protéique la plus sombre et les moins bons
résultats qualitatifs. Le protocole « WSP » se démarque quant à lui en
étant le protocole permettant d’obtenir la solution protéique la plus
claire et jusqu’alors le meilleur résultat qualitatif. Des améliorations
sont tout de même à apporter afin d’obtenir de meilleurs résultats
qualitatifs. Elles doivent se porter sur la purification de l’extrait et sur
le tampon de solubilisation nécessaire à la 2D. |
Extraction, quantifification et caractérisation des protéines du sol : vers un nouvel indicateur biologique ? [texte imprimé] / Amandine Clément, Auteur . - 2014 . - 57 p. ; Version papier + Cd. Mémoire de projet ingénieur
Lieu de stage : Agri'terr Esitpa (76130 Mont Saint Aignan)
Non confidentiel
Président du jury : Isabelle Gattin . Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
Bio-indicateur protéomique extraction protéines du sol sols agricoles grande culture prairie permanente sols limoneux Bradford électrophorèse 2-D SDS-PAGE |
| Résumé : |
L’étude des protéines du sol est importante, dans l’objectif de mieux
comprendre les fonctionnements biologique du sol. La protéomique du
sol est en effet une clé dans la compréhension des relations entre
structure et fonctions des communautés microbiennes. Elle pourrait
constituer un nouveau bio-indicateur.
Dans cette étude, six protocoles d’extraction des protéines ont été
testés (WSP, SP, SDS, NaOH, RG et ADN) sur un sol de grande
culture (GC) et un sol de prairie permanente (PP). La quantité de
protéines extraites par chaque protocole a été évaluée grâce au dosage
de Bradford. La qualité des extraits protéiques a été comparée par
électrophorèse mono (SDS-PAGE) et bi dimensionnelle (2D).
Tous les protocoles ont conduit à l’obtention d’extraits riches en
protéines (de 0.11 à 1.08 mg.g-1 de sol sec pour GC et de 0.13 à 0.95
mg.g-1 de sol sec pour PP). Le protocole « RG » donne les meilleurs
résultats quantitatifs autant en GC qu’en PP. Cependant c’est aussi
celui qui possède la solution protéique la plus sombre et les moins bons
résultats qualitatifs. Le protocole « WSP » se démarque quant à lui en
étant le protocole permettant d’obtenir la solution protéique la plus
claire et jusqu’alors le meilleur résultat qualitatif. Des améliorations
sont tout de même à apporter afin d’obtenir de meilleurs résultats
qualitatifs. Elles doivent se porter sur la purification de l’extrait et sur
le tampon de solubilisation nécessaire à la 2D. |
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Affiner la recherche Interroger des sources externesEtude des flux de matières et d'éléments en relation avec les pratiques agricoles au sein d'un système de polyculture-élevage autonome en AB / Amandine Clément / 2013
